À partir des principaux enjeux de santé du territoire, le COS détermine les 15 priorités de santé et les résultats attendus en termes d'amélioration de l'état de santé de la population, de lutte contre les inégalités et de fonctionnement du système de santé :
1. La démocratie en santé
2. La prévention dans le quotidien des réunionnais
3. Un environnement favorable à la santé
4. Des parcours de santé coordonnés et accessibles
5. La réduction des inégalités sociales et territoriales de santé
6. La santé de la femme
7. La santé de la mère et de l’enfant
8. La santé nutritionnelle
9. La santé mentale
10. Les conduites addictives
11. La qualité de vie et la santé des personnes vivant avec un handicap
12. La qualité de vie et la santé des personnes âgées
13. Les compétences et ressources humaines en santé
14. Le numérique au service de la santé
15. La veille et surveillance sanitaires, intégrant la dimension « une seule santé », et la réponse aux situations exceptionnelles